BLASTN 2.2.18 Mar-02-2008
Reference: Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,  Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),  "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Contig205
         (2012 letters)
Database: /home/vicky/BKPVICKY/BLASTdb/tabaco.fasta
         1 sequences; 430597 total letters
Searching................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value
gi|57013877|ref|NC_006581.1| Nicotiana tabacum mitochondrion ... 3776.9    0.0

>ref|NC_006581.1| Nicotiana tabacum mitochondrion, complete genome 

 Length = 430597


Score = 3776.88 bits (1905.0), Expect = 0.0
Identities = 1991/2023 (98%)
Strand = Plus/Plus

Query: 1      TAGCAGGTTGTTGGCTGGGAGAGCTGGTAAAAGAATGAAACCTTCAAGAGACCATGGTTA 60
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373609 TAGCAGGTTGTTGGCTGGGAGAGCTGGTAAAAGAATGAAACCTTCAAGAGACCATGGTTA 373668

Query: 61     ACAAGCCAGCTGAGGAAGAACAATCTCCCCCAGCAATACCGATCCTCCCTAGTTCAATCA 120
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373669 ACAAGCCAGCTGAGGAAGAACAATCTCCCCCAGCAATACCGATCCTCCCTAGTTCAATCA 373728

Query: 121    GAATCGAGAACTGCGGAGAGGTTCTAACCGGCCTAGCCTAACCAACCGCTACAAGCGGGC 180
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373729 GAATCGAGAACTGCGGAGAGGTTCTAACCGGCCTAGCCTAACCAACCGCTACAAGCGGGC 373788

Query: 181    AGGAAATAGATGTGGTGGAGACTCAAGTCAAGGCGATGGATCACTATCACTATAGATAGA 240
              |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373789 AGGAAATAGATGTGGTGGAGACTCAAGTCAAGGCAATGGATCACTATCACTATAGATAGA 373848

Query: 241    TGCTTTCCCTGGACTGTGTTCAATGGCACCTGATATGCCAACAAGGGCTTACTAAGAGAT 300
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373849 TGCTTTCCCTGGACTGTGTTCAATGGCACCTGATATGCCAACAAGGGCTTACTAAGAGAT 373908

Query: 301    CTTGCATGTTTTATAGGGTGCTTCTTATGTCTTTCCATAAGCAGAAGTATGAGTAGAGCT 360
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373909 CTTGCATGTTTTATAGGGTGCTTCTTATGTCTTTCCATAAGCAGAAGTATGAGTAGAGCT 373968

Query: 361    GCTCTTCCCCTATTCTGAATCCCACTTCTTATGTCTGTCAACAGGAGCCCAGCCCCTGGT 420
              |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 373969 GCTCTTCCCCTATTCTTAATCCCACTTCTTATGTCTGTCAACAAGAGCCCAGCCCCTGGT 374028

Query: 421    TCAATCGATAGATAGGCCGAAAACATATTTCTGGACAAATGAACAGACCTTTCCTT---- 476
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct: 374029 TCAATCGATAGATAGGCCGAAAACATATTTCTGGACAAATGAACAGACCTTTCCTTACTT 374088

Query: 477    ---TTGCCAACAAACCGGTCAAACCAGTAACCAAGTTCATGCGTCAGTACCACGTCCAGG 533
                 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374089 GACTTGCCAACAAAGCGGTCAAACCAGTAACCAAGTTCATGCGTCAGTACCACGTCCAGG 374148

Query: 534    ATCTTAGGAAAGGGGAAGCTCAAATGATATCTAATGGGATGGGCATGCTCCCCACTGCTC 593
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374149 ATCTTAGGAAAGGGGAAGCTCAAATGATATCTAATGGGATGGGCATGCTCCCCACTGCTC 374208

Query: 594    TATGATTTATTATAGTCATACTCTGTTTCGTACCTGGTAGCTAGCCTTTCGCTTCCTCCT 653
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374209 TATGATTTATTATAGTCATACTCTGTTTCGTACCTGGTAGCTAGCCTTTCGCTTCCTCCT 374268

Query: 654    TGTACTAGATTTTTACTTGAATTCCCCCTGAAAGCGAGAACGCACTATATGCCTTTAAAA 713
              ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374269 TGTACTAGATTTTGACTTGAATTCCCCCTGAAAGCGAGAACGCACTATATGCCTTTAAAA 374328

Query: 714    TAAAAAGAAGGCTGGAAAAAAGAGAGAGCTCCTTTCTTTTCTAGCTTTGGCGGGAGGAAT 773
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374329 TAAAAAGAAGGCTGGAAAAAAGAGAGAGCTCCTTTCTTTTCTAGCTTTGGCGGGAGGAAT 374388

Query: 774    GAAAATCCTATCCTATACGAAGGCCTATATNNNNNNNNNGCACTTTGCCTAGAATCCCAA 833
              ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||
Sbjct: 374389 GAAAATCCTATCCTATACGAAGGCCTATATACAAAAAAAGCACTTTGCCTAGAATCCCAA 374448

Query: 834    GTTGCCTCCCCTCTCCTCTGAGGCCGATCGCATCCACTTTTGGAGCCCCTCGCCTTTGAG 893
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374449 GTTGCCTCCCCTCTCCTCTGAGGCCGATCGCATCCGCTTTTGGAGCCCCTCGCCTTTGAG 374508

Query: 894    TACGGCAGCAGCCCAGACATAGACCTAATTAGGGGCCTAAACTCTTGAGTAGATTGCCCA 953
              ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374509 TACGGCAGCAGCCCAGACATAGACCGAATTAGGGGCCTAAACTCTTGAGTAGATTGCCCA 374568

Query: 954    TGGAAGGGAGCTTACTCCAAGATCTGACTCCCCCCGTGTAGGAGTTCGGGAAGGCCAGAA 1013
              ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374569 TGGAAAGGAGCTTACTCCAAGATCTGACTCCGCCCGTGTAGGAGTTCGGGAAGGCCAGAA 374628

Query: 1014   GTAAACAAAGAGCGGTAGAAGAGAATAAAGTGTTGCGCCCATTCTTTTCTTTCATAGCTG 1073
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374629 GTAAACAAAGAGCGGTAGAAGAGAATAAAGTGTTGCGCCCATTCTTTTCTTTCATAGCTG 374688

Query: 1074   GAGCAAATGGAAGGAGACGTCGTGCAAGCCGAAGACTTTGACAGGTGTCGGTAGGCACGC 1133
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374689 GAGCAAATGGAAGGAGACGTCGTGCAAGCCGAAGACTTTGACAGGTGTCGGTAGGCACGC 374748

Query: 1134   CTCTGATAAGGGCTCGATCCTGAGAATCAATCCCAATCGAATCTATGGAAGGGAGACCCT 1193
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374749 CTCTGATAAGGGCTCGATCCTGAGAATCAATCCCAATCGAATCTATGGAAGGGAGACCCT 374808

Query: 1194   CTATCCTCTTAATCTTTAGAGTAGATATTATATATAGGATAATAAGTCCACTGCGGTGCC 1253
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 374809 CTATCCTCTTAATCTTTAGAGTAGATATTATATATAGGATAATCAGTCCACTGCGGTGCC 374868

Query: 1254   CAAGACAAGGCAAGATGAATAGGAATGTTGAAGGGACATAAGGCTCAGCTAAGGTAAGGA 1313
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374869 CAAGACAAGGCAAGATGAATAGGAATGTTGAAGGGACATAAGGCTCAGCTAAGGTAAGGA 374928

Query: 1314   AAGACCCTGACCATCTAGGTCACCAA----TCTTCTTTTTTAGGGAGTCGGAGACGATCG 1369
              ||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374929 AAGACCCTGACCATCTAGGTCACCAAGTACTCTTATTTTTTAGGGAGTCGGAGACGATCG 374988

Query: 1370   AAGAGGCAGCAAAATAGGAACTTTCGATCAGGGAGAGCTCAACAAGGTCGAGACCAAGAT 1429
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374989 AAGAGGCAGCAAAATAGGAACTTTCGATCAGGGAGAGCTCAACAAGGTCGAGACCAAGAT 375048

Query: 1430   GATGGATATTCCAAGGAAGATCGAAGAAGATGAATGAAGGTTTATACCTACCCCTAACTG 1489
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375049 GATGGATATTCCAAGGAAGATCGAAGAAGATGAATGAAGGTTTATACCTACCCCTAACTG 375108

Query: 1490   GCACTATGAATCCAATCCCATCTACATAGATGTTCCTAGCCACGAGATGAGGGGGTTCTC 1549
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375109 GCACTATGAATCCAATCCCATCTACATAGATGTTCCTAGCCACGAGATGAGGGGGTTCTC 375168

Query: 1550   TCTTACTGTTAAGCCGTCTTCAACTCTTCTTTCTTTACTCCTTTCCGCATCGGGGCTGAT 1609
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375169 TCTTACTGTTAAGCCGTCTTCAACTCTTCTTTCTTTACTCCTTTCCGCATCGGGGCTGAT 375228

Query: 1610   AATTGGATAGAATCTCCTTAAATAAAGAAAGGGGGCGTATAAATTGGGTTTTTGGCTCGC 1669
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375229 AATTGGATAGAATCTCCTTAAATAAAGAAAGGGGGCGTATAAATTGGGTTTTTGGCTCGC 375288

Query: 1670   AATAAAGCTAGGGTCCTGATCGAGCAACTAGTAGTCCTATCTATCCACCTCTCCAGACAC 1729
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375289 AATAAAGCTAGGGTCCTGATCGAGCAACTAGTAGTCCTATCTATCCACCTCTCCAGACAC 375348

Query: 1730   AATATCTTGAGTGCCTATGATGGTGACCACATCTGCTGGCATGTGATGTTTGGACATAGA 1789
              |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375349 AATATCTTGAGTACCTATGATGGTGACCACATCTGCTGGCATGTGATGTTTGGACATAGA 375408

Query: 1790   ATCGAGTCCTTGTGAATGGGCAAAGCCAGGTGCTCTTATTTTACGACGGTAGGGACGATT 1849
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375409 ATCGAGTCCTTGTGAATGGGCAAAGCCAGGTGCTCTTATTTTACGACGGTAGGGACGATT 375468

Query: 1850   GCTTCCATTACTGACCAGAAAGACACCAAATTCTCCTTTAGGTGCTTCAACTGCGGTATA 1909
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375469 GCTTCCATTACTGACCAGAAAGACACCAAATTCTCCTTTAGGTGCTTCAACTGCGGTATA 375528

Query: 1910   GGTAGAAGGAGCTGGTACGGAAAAACCTTCTGTATAAGGTTCGAAATGGTGAATTGAGGT 1969
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375529 GGTAGAAGGAGCTGGTACGGAAAAACCTTCTGTATAAGGTTCGAAATGGTGAATTGAGGT 375588

Query: 1970   AGAGTAGACCGATGATCCTGTAGTCATTTGGCCGGCTATTGAA 2012
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375589 AGAGTAGACCGATGATCCTGTAGTCATTTGGCCGGCTATTGAA 375631


  Database: /home/vicky/BKPVICKY/BLASTdb/tabaco.fasta
  Number of letters in database: 430597
  Number of sequences in database:  1

Lambda     K      H
    1.37    0.711     1.31

Matrix: BLASTN matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 1
Length of database: 430597