BLASTN 2.2.18 Mar-02-2008
Reference: Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Contig133
(906 letters)
Database: /home/vicky/BKPVICKY/BLASTdb/tabaco.fasta
1 sequences; 430597 total letters
Searching................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|57013877|ref|NC_006581.1| Nicotiana tabacum mitochondrion ... 1519.0 0.0
>ref|NC_006581.1| Nicotiana tabacum mitochondrion, complete genome
Length = 430597
Score = 1518.98 bits (766.0), Expect = 0.0
Identities = 769/770 (100%)
Strand = Plus/Minus
Query: 783 CGGTAGTTGTCCGGTCGTACCCAAACAATAATATTCCAGAGGGAAATGCACCTAAGATCA 724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276527 CGGTAGTTGTCCGGTCGTACCCAAACAATAATATTCCAGAGGGAAATGCACCTAAGATCA 276586
Query: 723 AATATTTCGAGCCGGCTTCCGTAGAAAATTCAGACTTTCTTTTTGATGCTGCGATCACAT 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276587 AATATTTCGAGCCGGCTTCCGTAGAAAATTCAGACTTTCTTTTTGATGCTGCGATCACAT 276646
Query: 663 AAAAACATAAACTTTGAGGCTCAATAGCTAAATACATGGCAATTGAATCATAAGCCGAGA 604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276647 AAAAACATAAACTTTGAGGCTCAATAGCTAAATACATGGCAATTGAATCATAAGCCGAGA 276706
Query: 603 TCATAAAGAGCATACCGCGAGTAGGAAGTGGAATTAATACAATGGATTCAAAAGCATCAA 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276707 TCATAAAGAGCATACCGCGAGTAGGAAGTGGAATTAATACAATGGATTCAAAAGCATCAA 276766
Query: 543 ACCTCTCTTGTTCGAAAGAATTGAAACACATCGAAATGGTACCAGCCGTACTTAATAATA 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276767 ACCTCTCTTGTTCGAAAGAATTGAAACACATCGAAATGGTACCAGCCGTACTTAATAATA 276826
Query: 483 GAAGGATTTGGCAGAAATATGTAAAATTGTCCCTCCTAAAAAGATTATTCCAGAATAAAT 424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276827 GAAGGATTTGGCAGAAATATGTAAAATTGTCCCTCCTAAAAAGATTATTCCAGAATAAAT 276886
Query: 423 GGGCAATAGTTAGGAGAGGTGCGCCAGCGGCGAGCAGAAGCAAGGTTATTAGATACCTCA 364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276887 GGGCAATAGTTAGGAGAGGTGCGCCAGCGGCGAGCAGAAGCAAGGTTATTAGATACCTCA 276946
Query: 363 GGAAAGCCCGGCCAGAACCACACGTGCAAGTTTCCCTGCATGTGGCTCGTCCGTGATAAC 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276947 GGAAAGCCCGGCCAGAACCACACGTGCAAGTTTCCCTGCATGTGGCTCGTCCGTGATAAC 277006
Query: 303 TTCTTCGGATTTGCGTGAACTAGCGGACCGATCACTAAGTGGGGATGCTCCCTCCAGCAT 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 277007 TTCTTCGGATTTGCGTGAACTAGCGGACCGATCACTAAGTGGGGATGCTCCCTCCAGCAT 277066
Query: 243 GAGCGAACCCTTTCGGAACTGGTTAAGAATGGGCGCCACTATCCCAGCCCGGATCCAGCC 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 277067 GAGCGAACCCTTTCGGAACTGGTTAAGAATGGGCGGCACTATCCCAGCCCGGATCCAGCC 277126
Query: 183 AGGTTCTATTGATCATGTCCCCTTCCCAACAGTTGTACCTTGTCTTGGGGCGTCTTTGGC 124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 277127 AGGTTCTATTGATCATGTCCCCTTCCCAACAGTTGTACCTTGTCTTGGGGCGTCTTTGGC 277186
Query: 123 TTTACGATAGAAAGCTCGCCGGAGAAAGCCAGGTGCCGTAGGTAAGCTCTATTTGGCCCG 64
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 277187 TTTACGATAGAAAGCTCGCCGGAGAAAGCCAGGTGCCGTAGGTAAGCTCTATTTGGCCCG 277246
Query: 63 GAGCATTGATTTCCCATAACGAATAGGCTAGCTCTATCTCTCAATTACCT 14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 277247 GAGCATTGATTTCCCATAACGAATAGGCTAGCTCTATCTCTCAATTACCT 277296
Score = 1304.88 bits (658.0), Expect = 0.0
Identities = 661/662 (100%)
Strand = Plus/Minus
Query: 675 CTGCGATCACATAAAAACATAAACTTTGAGGCTCAATAGCTAAATACATGGCAATTGAAT 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75135 CTGCGATCACATAAAAACATAAACTTTGAGGCTCAATAGCTAAATACATGGCAATTGAAT 75194
Query: 615 CATAAGCCGAGATCATAAAGAGCATACCGCGAGTAGGAAGTGGAATTAATACAATGGATT 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75195 CATAAGCCGAGATCATAAAGAGCATACCGCGAGTAGGAAGTGGAATTAATACAATGGATT 75254
Query: 555 CAAAAGCATCAAACCTCTCTTGTTCGAAAGAATTGAAACACATCGAAATGGTACCAGCCG 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75255 CAAAAGCATCAAACCTCTCTTGTTCGAAAGAATTGAAACACATCGAAATGGTACCAGCCG 75314
Query: 495 TACTTAATAATAGAAGGATTTGGCAGAAATATGTAAAATTGTCCCTCCTAAAAAGATTAT 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75315 TACTTAATAATAGAAGGATTTGGCAGAAATATGTAAAATTGTCCCTCCTAAAAAGATTAT 75374
Query: 435 TCCAGAATAAATGGGCAATAGTTAGGAGAGGTGCGCCAGCGGCGAGCAGAAGCAAGGTTA 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75375 TCCAGAATAAATGGGCAATAGTTAGGAGAGGTGCGCCAGCGGCGAGCAGAAGCAAGGTTA 75434
Query: 375 TTAGATACCTCAGGAAAGCCCGGCCAGAACCACACGTGCAAGTTTCCCTGCATGTGGCTC 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75435 TTAGATACCTCAGGAAAGCCCGGCCAGAACCACACGTGCAAGTTTCCCTGCATGTGGCTC 75494
Query: 315 GTCCGTGATAACTTCTTCGGATTTGCGTGAACTAGCGGACCGATCACTAAGTGGGGATGC 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75495 GTCCGTGATAACTTCTTCGGATTTGCGTGAACTAGCGGACCGATCACTAAGTGGGGATGC 75554
Query: 255 TCCCTCCAGCATGAGCGAACCCTTTCGGAACTGGTTAAGAATGGGCGCCACTATCCCAGC 196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 75555 TCCCTCCAGCATGAGCGAACCCTTTCGGAACTGGTTAAGAATGGGCGGCACTATCCCAGC 75614
Query: 195 CCGGATCCAGCCAGGTTCTATTGATCATGTCCCCTTCCCAACAGTTGTACCTTGTCTTGG 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75615 CCGGATCCAGCCAGGTTCTATTGATCATGTCCCCTTCCCAACAGTTGTACCTTGTCTTGG 75674
Query: 135 GGCGTCTTTGGCTTTACGATAGAAAGCTCGCCGGAGAAAGCCAGGTGCCGTAGGTAAGCT 76
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75675 GGCGTCTTTGGCTTTACGATAGAAAGCTCGCCGGAGAAAGCCAGGTGCCGTAGGTAAGCT 75734
Query: 75 CTATTTGGCCCGGAGCATTGATTTCCCATAACGAATAGGCTAGCTCTATCTCTCAATTAC 16
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75735 CTATTTGGCCCGGAGCATTGATTTCCCATAACGAATAGGCTAGCTCTATCTCTCAATTAC 75794
Query: 15 CT 14
||
Sbjct: 75795 CT 75796
Score = 1304.88 bits (658.0), Expect = 0.0
Identities = 661/662 (100%)
Strand = Plus/Minus
Query: 675 CTGCGATCACATAAAAACATAAACTTTGAGGCTCAATAGCTAAATACATGGCAATTGAAT 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 425885 CTGCGATCACATAAAAACATAAACTTTGAGGCTCAATAGCTAAATACATGGCAATTGAAT 425944
Query: 615 CATAAGCCGAGATCATAAAGAGCATACCGCGAGTAGGAAGTGGAATTAATACAATGGATT 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 425945 CATAAGCCGAGATCATAAAGAGCATACCGCGAGTAGGAAGTGGAATTAATACAATGGATT 426004
Query: 555 CAAAAGCATCAAACCTCTCTTGTTCGAAAGAATTGAAACACATCGAAATGGTACCAGCCG 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426005 CAAAAGCATCAAACCTCTCTTGTTCGAAAGAATTGAAACACATCGAAATGGTACCAGCCG 426064
Query: 495 TACTTAATAATAGAAGGATTTGGCAGAAATATGTAAAATTGTCCCTCCTAAAAAGATTAT 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426065 TACTTAATAATAGAAGGATTTGGCAGAAATATGTAAAATTGTCCCTCCTAAAAAGATTAT 426124
Query: 435 TCCAGAATAAATGGGCAATAGTTAGGAGAGGTGCGCCAGCGGCGAGCAGAAGCAAGGTTA 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426125 TCCAGAATAAATGGGCAATAGTTAGGAGAGGTGCGCCAGCGGCGAGCAGAAGCAAGGTTA 426184
Query: 375 TTAGATACCTCAGGAAAGCCCGGCCAGAACCACACGTGCAAGTTTCCCTGCATGTGGCTC 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426185 TTAGATACCTCAGGAAAGCCCGGCCAGAACCACACGTGCAAGTTTCCCTGCATGTGGCTC 426244
Query: 315 GTCCGTGATAACTTCTTCGGATTTGCGTGAACTAGCGGACCGATCACTAAGTGGGGATGC 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426245 GTCCGTGATAACTTCTTCGGATTTGCGTGAACTAGCGGACCGATCACTAAGTGGGGATGC 426304
Query: 255 TCCCTCCAGCATGAGCGAACCCTTTCGGAACTGGTTAAGAATGGGCGCCACTATCCCAGC 196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 426305 TCCCTCCAGCATGAGCGAACCCTTTCGGAACTGGTTAAGAATGGGCGGCACTATCCCAGC 426364
Query: 195 CCGGATCCAGCCAGGTTCTATTGATCATGTCCCCTTCCCAACAGTTGTACCTTGTCTTGG 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426365 CCGGATCCAGCCAGGTTCTATTGATCATGTCCCCTTCCCAACAGTTGTACCTTGTCTTGG 426424
Query: 135 GGCGTCTTTGGCTTTACGATAGAAAGCTCGCCGGAGAAAGCCAGGTGCCGTAGGTAAGCT 76
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426425 GGCGTCTTTGGCTTTACGATAGAAAGCTCGCCGGAGAAAGCCAGGTGCCGTAGGTAAGCT 426484
Query: 75 CTATTTGGCCCGGAGCATTGATTTCCCATAACGAATAGGCTAGCTCTATCTCTCAATTAC 16
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426485 CTATTTGGCCCGGAGCATTGATTTCCCATAACGAATAGGCTAGCTCTATCTCTCAATTAC 426544
Query: 15 CT 14
||
Sbjct: 426545 CT 426546
Score = 97.6282 bits (49.0), Expect = 1.56818e-21
Identities = 49/49 (100%)
Strand = Plus/Minus
Query: 357 CCCGGCCAGAACCACACGTGCAAGTTTCCCTGCATGTGGCTCGTCCGTG 309
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 143106 CCCGGCCAGAACCACACGTGCAAGTTTCCCTGCATGTGGCTCGTCCGTG 143154
Score = 65.9106 bits (33.0), Expect = 5.53814e-12
Identities = 39/42 (93%)
Strand = Plus/Minus
Query: 886 TGCAAGTTTCACATNTAAGTAANACCCGANCCGATAGTTTAC 845
|||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct: 276424 TGCAAGTTTCACATCTAAGTAATACCCGATCCGATAGTTTAC 276465
Database: /home/vicky/BKPVICKY/BLASTdb/tabaco.fasta
Number of letters in database: 430597
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: BLASTN matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 1
Length of database: 430597