BLASTN 2.2.18 Mar-02-2008
Reference: Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Contig106
(942 letters)
Database: /home/vicky/BKPVICKY/BLASTdb/tabaco.fasta
1 sequences; 430597 total letters
Searching................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|57013877|ref|NC_006581.1| Nicotiana tabacum mitochondrion ... 1189.9 0.0
>ref|NC_006581.1| Nicotiana tabacum mitochondrion, complete genome
Length = 430597
Score = 1189.91 bits (600.0), Expect = 0.0
Identities = 618/624 (99%)
Strand = Plus/Plus
Query: 13 AGGAGAATCAACAAGATAGGATGCTCTGGCCCAACTAACAAGAGTAGGAAGATTCCAGCT 72
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78559 AGGAGAATCAACAAGATAGGATGCTCTGTCCCAACTAACAAGAGTAGGAAGATTCCAGCT 78618
Query: 73 TTGAATCTTGTGCTTGACGGTGATCATTTCTGCCACGTCATAACAGTCTTTAGTGCTTTC 132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 78619 TTGAATCTTGTGCTTGACGGTGATCATTTCTGCCACGTCGTAACAGTCTTTAGTGCTTTC 78678
Query: 133 TGTTTCAATGGTTTGGAACCCTTCTTACTTTCTTTATTATATCGGGGAATTTTTTCTCTT 192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 78679 TGTTTCAATGGTTTGGAACCCTTCTTACTTTCTTTATTATATCGGGGAATTTTTGCTCTT 78738
Query: 193 GGTCCGCTAACTCCATAAGGGGCTGGTGGGCGGGGGTAGAGCCTCTAGCGCCAATGTCGA 252
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78739 GGTCCGCTAACTCCATAAAGGGCTGGTGGGTGGGGGTAGAGCCTCTAGCGCCAATGTCGA 78798
Query: 253 TGAAGCAAAGGTGTCTGTTTATGGTATGGAATAGGAAGAGCAAGAATGGAACCGCTATCG 312
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78799 TGAATCAAAGGTGTCTGTTTATGGTATGGAATAGGAAGAGCAAGAATGGAACCGCTATCG 78858
Query: 313 CTTGTCCTATCATCCGCGATGAGCTTCTTTCATTCGTCAGTATGGGGTAGGTAGAGTCCT 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78859 CTTGTCCTATCATCCGCGATGAGCTTCTTTCATTCGTCAGTATGGGGTAGGTAGAGTCCT 78918
Query: 373 TTGCTCGTATGCTTGGCATTACTATAGTCGCACCAGTCTTCCTTCCTTTTTAGTGCACAT 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78919 TTGCTCGTATGCTTGGCATTACTATAGTCGCACCAGTCTTCCTTCCTTTTTAGTGCACAT 78978
Query: 433 GAAACGGAAACCCTAATAGAGACTACCCACACGGTGATCAAAACTCTTCCTTCTCTGCTT 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78979 GAAACGGAAACCCTAATAGAGACTACCCACACGGTGATCAAAACTCTTCCTTCTCTGCTT 79038
Query: 493 CACTGTCAATTGATTGGCGCATGAACGAAGCTGTAACGGAGCATGTACGCGACGATCAAA 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 79039 CACTGTCAATTGATTGGCGCATGAACGAAGCTGTAACGGAGCATGTACGCGACGATCAAA 79098
Query: 553 CACGGCTTTGCCAGCTGCCTGTGATAGGAAAAAGAAAACTTGATCAGATAGTTCGTGCGG 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 79099 CACGGCTTTGCCAGCTGCCTGTGATAGGAAAAAGAAAACTTGATCAGATAGTTCGTGCGG 79158
Query: 613 GGCATTTCCCACCTCGCCTTTGAT 636
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 79159 GGCATTTCCCACCTCGCCTTTGAT 79182
Score = 1189.91 bits (600.0), Expect = 0.0
Identities = 618/624 (99%)
Strand = Plus/Plus
Query: 13 AGGAGAATCAACAAGATAGGATGCTCTGGCCCAACTAACAAGAGTAGGAAGATTCCAGCT 72
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280059 AGGAGAATCAACAAGATAGGATGCTCTGTCCCAACTAACAAGAGTAGGAAGATTCCAGCT 280118
Query: 73 TTGAATCTTGTGCTTGACGGTGATCATTTCTGCCACGTCATAACAGTCTTTAGTGCTTTC 132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 280119 TTGAATCTTGTGCTTGACGGTGATCATTTCTGCCACGTCGTAACAGTCTTTAGTGCTTTC 280178
Query: 133 TGTTTCAATGGTTTGGAACCCTTCTTACTTTCTTTATTATATCGGGGAATTTTTTCTCTT 192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 280179 TGTTTCAATGGTTTGGAACCCTTCTTACTTTCTTTATTATATCGGGGAATTTTTGCTCTT 280238
Query: 193 GGTCCGCTAACTCCATAAGGGGCTGGTGGGCGGGGGTAGAGCCTCTAGCGCCAATGTCGA 252
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280239 GGTCCGCTAACTCCATAAAGGGCTGGTGGGTGGGGGTAGAGCCTCTAGCGCCAATGTCGA 280298
Query: 253 TGAAGCAAAGGTGTCTGTTTATGGTATGGAATAGGAAGAGCAAGAATGGAACCGCTATCG 312
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280299 TGAATCAAAGGTGTCTGTTTATGGTATGGAATAGGAAGAGCAAGAATGGAACCGCTATCG 280358
Query: 313 CTTGTCCTATCATCCGCGATGAGCTTCTTTCATTCGTCAGTATGGGGTAGGTAGAGTCCT 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280359 CTTGTCCTATCATCCGCGATGAGCTTCTTTCATTCGTCAGTATGGGGTAGGTAGAGTCCT 280418
Query: 373 TTGCTCGTATGCTTGGCATTACTATAGTCGCACCAGTCTTCCTTCCTTTTTAGTGCACAT 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280419 TTGCTCGTATGCTTGGCATTACTATAGTCGCACCAGTCTTCCTTCCTTTTTAGTGCACAT 280478
Query: 433 GAAACGGAAACCCTAATAGAGACTACCCACACGGTGATCAAAACTCTTCCTTCTCTGCTT 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280479 GAAACGGAAACCCTAATAGAGACTACCCACACGGTGATCAAAACTCTTCCTTCTCTGCTT 280538
Query: 493 CACTGTCAATTGATTGGCGCATGAACGAAGCTGTAACGGAGCATGTACGCGACGATCAAA 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280539 CACTGTCAATTGATTGGCGCATGAACGAAGCTGTAACGGAGCATGTACGCGACGATCAAA 280598
Query: 553 CACGGCTTTGCCAGCTGCCTGTGATAGGAAAAAGAAAACTTGATCAGATAGTTCGTGCGG 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280599 CACGGCTTTGCCAGCTGCCTGTGATAGGAAAAAGAAAACTTGATCAGATAGTTCGTGCGG 280658
Query: 613 GGCATTTCCCACCTCGCCTTTGAT 636
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280659 GGCATTTCCCACCTCGCCTTTGAT 280682
Score = 1189.91 bits (600.0), Expect = 0.0
Identities = 618/624 (99%)
Strand = Plus/Plus
Query: 13 AGGAGAATCAACAAGATAGGATGCTCTGGCCCAACTAACAAGAGTAGGAAGATTCCAGCT 72
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429309 AGGAGAATCAACAAGATAGGATGCTCTGTCCCAACTAACAAGAGTAGGAAGATTCCAGCT 429368
Query: 73 TTGAATCTTGTGCTTGACGGTGATCATTTCTGCCACGTCATAACAGTCTTTAGTGCTTTC 132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 429369 TTGAATCTTGTGCTTGACGGTGATCATTTCTGCCACGTCGTAACAGTCTTTAGTGCTTTC 429428
Query: 133 TGTTTCAATGGTTTGGAACCCTTCTTACTTTCTTTATTATATCGGGGAATTTTTTCTCTT 192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 429429 TGTTTCAATGGTTTGGAACCCTTCTTACTTTCTTTATTATATCGGGGAATTTTTGCTCTT 429488
Query: 193 GGTCCGCTAACTCCATAAGGGGCTGGTGGGCGGGGGTAGAGCCTCTAGCGCCAATGTCGA 252
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429489 GGTCCGCTAACTCCATAAAGGGCTGGTGGGTGGGGGTAGAGCCTCTAGCGCCAATGTCGA 429548
Query: 253 TGAAGCAAAGGTGTCTGTTTATGGTATGGAATAGGAAGAGCAAGAATGGAACCGCTATCG 312
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429549 TGAATCAAAGGTGTCTGTTTATGGTATGGAATAGGAAGAGCAAGAATGGAACCGCTATCG 429608
Query: 313 CTTGTCCTATCATCCGCGATGAGCTTCTTTCATTCGTCAGTATGGGGTAGGTAGAGTCCT 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429609 CTTGTCCTATCATCCGCGATGAGCTTCTTTCATTCGTCAGTATGGGGTAGGTAGAGTCCT 429668
Query: 373 TTGCTCGTATGCTTGGCATTACTATAGTCGCACCAGTCTTCCTTCCTTTTTAGTGCACAT 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429669 TTGCTCGTATGCTTGGCATTACTATAGTCGCACCAGTCTTCCTTCCTTTTTAGTGCACAT 429728
Query: 433 GAAACGGAAACCCTAATAGAGACTACCCACACGGTGATCAAAACTCTTCCTTCTCTGCTT 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429729 GAAACGGAAACCCTAATAGAGACTACCCACACGGTGATCAAAACTCTTCCTTCTCTGCTT 429788
Query: 493 CACTGTCAATTGATTGGCGCATGAACGAAGCTGTAACGGAGCATGTACGCGACGATCAAA 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429789 CACTGTCAATTGATTGGCGCATGAACGAAGCTGTAACGGAGCATGTACGCGACGATCAAA 429848
Query: 553 CACGGCTTTGCCAGCTGCCTGTGATAGGAAAAAGAAAACTTGATCAGATAGTTCGTGCGG 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429849 CACGGCTTTGCCAGCTGCCTGTGATAGGAAAAAGAAAACTTGATCAGATAGTTCGTGCGG 429908
Query: 613 GGCATTTCCCACCTCGCCTTTGAT 636
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429909 GGCATTTCCCACCTCGCCTTTGAT 429932
Score = 577.358 bits (291.0), Expect = 6.3031e-166
Identities = 298/301 (99%)
Strand = Plus/Minus
Query: 928 CCCAGTCTCTGGTCANNCCATGCTGATGCTAGAAGAGCTATTCCCGCCGCCCACCCGAAA 869
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291970 CCCAGTCTCTGGTCAATCCATGCTGATGCTAGAAGAGCTATTCCCGCCGCCCACCCGAAA 292029
Query: 868 GAGACGAGGAAGACTAACCGCCATCCTGCTCGAACCTTTGCTGCCTGAGTTATATAGCTG 809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292030 GAGACGAGGAAGACTAACCGCCATCCTGCTCGAACCTTTGCTGCCTGAGTTATATAGCTG 292089
Query: 808 ACTGCGAGAAGGAAGGTTCAAGCTATGGCTGCCCCATGGGATGCTCATTTGAAACCTTTG 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292090 ACTGCGAGAAGGAAGGTTCAAGCTATGGCTGCCCCATGGGATGCTCATTTGAAACCTTTG 292149
Query: 748 TCCGGTCAATGCGAGAAAGAGAGAAGTGATGTAAACATAAGAATGGAAGGTTTGCTTGTC 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292150 TCCGGTCAATGCGAGAAAGAGAGAAGTGATGTAAACATAAGAATGGAAGGTTTGCTTGTC 292209
Query: 688 AGCTGTCGGGCCAATGATGCTCTTCTAGCTTTACCTACACGGCAAGGGAAAGATCAAAGG 629
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292210 AGCTGTCGGGCCAATGAGGCTCTTCTAGCTTTACCTACACGGCAAGGGAAAGATCAAAGG 292269
Query: 628 C 628
|
Sbjct: 292270 C 292270
Score = 79.787 bits (40.0), Expect = 3.83099e-16
Identities = 43/44 (98%)
Strand = Plus/Plus
Query: 383 GCTTGGCATTACTATAGTCGCACCAGTCTTCCTTCCTTTTTAGT 426
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 246469 GCTTGGCATTACTATTGTCGCACCAGTCTTCCTTCCTTTTTAGT 246512
Database: /home/vicky/BKPVICKY/BLASTdb/tabaco.fasta
Number of letters in database: 430597
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: BLASTN matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 1
Length of database: 430597